Le potentiel de bois-énergie en Franche-Comté (Doubs, Haute-Saône, Jura et Territoire de Belfort) est important. Il est majoritairement constitué  de bois déchiqueté nommé plaquettes forestières obtenues par déchiquetage des rémanents forestiers. Selon l’ADEME la ressource de Franche-Comté est de 81200 tep/an. Les plans d'approvisionnement territoriaux (PAT) vont permettre d'obtenir des informations plus précises sur cette ressource (quantité, prix, types de bois, localisation, dessertes). Les territoires actuellement couverts par les PAT se trouvent dans les départements du  Doubs et du Jura : pays Loue-Lison, Haut-Doubs, Lacs Petite Montagne et Haut-Jura.

Les autres produits issus des industries du bois (écorces, chutes, rebuts et sciures) nommés connexes des industries du bois sont déjà utilisés principalement pour les besoins des industries de première transformation du bois (scieries) et la trituration (papier, panneaux de particules). Une partie de la sciure produite sert également à fabriquer le granulé de bois (ou pellets).

En fonction de leur qualités, d’autres ressources bois peuvent être valorisées : les bois d’entretien des haies (bocages)  etde bords de route, d'élagage, les sarments de vignes, les bois plantés pour l'épuration, les taillis à courte rotation (TCR) et à très courte rotation (TTCR).

La valorisation énergétique des bois souillés qui ne sont pas à l’état naturel (traitements chimiques, peintures…) peuvent être acheminés vers des chaufferies industrielles qui équipées de traitements de fumées au minimum conformes aux réglementations.

La récolte des rémanents forestiers (branches, houppiers, résidus de coupe, sous-produits d'éclaircies) est possible grâce à la mise en place de dessertes forestières adaptées, de hangars de stockage permettant le séchage du bois par fermentation et des équipements logistiques (chargeurs, camions de livraison, bennes). Le bois est déchiqueté avec des déchiqueteuses performantes et automatisées qui permettent d’assurer la qualité du bois. La préparation du chantier et son organisation est également primordiale.

La consommation actuelle de bois déchiqueté en Franche-Comté développée grâce au Plan Bois Energie et Développement Local s'élève à 155 000 tonnes, dont 52 000 tonnes de plaquettes forestières (source ADEME 2008).  L'utilisation de ce bois-énergie dans les 413 chaufferies a permis la création de plus de 120 emplois notamment dans la filière de production et de livraison de combustible et  pour l'entretien et la maintenance des chaufferies.

En comparaison aux combustibles fossiles classiques, les avantages du bois-énergie sont nombreux :
- à consommation d'énergie équivalente, le bois-énergie crée 3 à 4 fois plus d'emploi que le fioul ou le gaz.
- les émissions de CO₂ issues de la combustion du bois sont considérées comme absorbées par la croissance des arbres suivant le principe du cycle du carbone forestier. L'accroissement annuel des forêts, mesuré en m³ par an et par hectare, mesure la quantité annuelle de ressource renouvelable disponible (matière et énergie), dans la mesure où les forêts sont gérées durablement, ce qui est le cas dans nos régions.

Cependant en développant le bois-énergie, il est important de ne pas soustraire de matière aux filières bois matériau (panneaux de bois, construction meubles, objets...) qui représente  en Franche-Comté une quantité d'emploi supérieure (7000 emplois) et un potentiel supérieur à savoir 7 emplois pour 1000 m³ (source INSEE). Ramené en emploi par tep, on obtient 65 emplois pour 1000 tep.

Les données précédentes sont semblables aux résultats de l'étude ADEME 2007 (lien ci-dessous) qui compare le rendement emploi  à temps plein (ETP) crée / quantité d'énergie bois mobilisée de 1000 tonnes équivalent pétrole (tep). Les filières locales pour les chaufferies de petites puissance sont davantage pourvoyeuses d'emploi que les filières industrielles. Les résultats principaux sont :

Emplois crées pour la production de bois-énergie
- plaquette bocagères :    11.0 ETP, (production)
- plaquettes forestières :    6.4 ETP, (production)
- produits connexes :         1.6 ETP, (production)
- plateforme de stockage : 1.2 ETP, (production)
- granulés :                        1.0 ETP, (production)

Emplois crées pour les usages de bois-énergie
- chaufferie collective  :      1.8 ETP (exploitation, puissance de chaudière < 1 MW)
- cogénération :                 0.24 ETP (exploitation)

Pour comparaison la filière bois matériau de Franche-Comté représente 64.0 ETP pour l'exploitation et transformation de la ressource.